Przetargi.pl
Dostawa pakietów oprogramowania statystycznego; Nr sprawy UM-ZP-262-57/11

Uniwersytet Medyczny w Lublinie ogłasza przetarg

  • Adres: 20-059 Lublin, Al. Racławickie 1
  • Województwo: lubelskie
  • Telefon/fax: tel. 81 528 88 88 , fax. 81 528 89 18
  • Data zamieszczenia: 2011-05-31
  • Zamieszczanie ogłoszenia: obowiązkowe

Sekcja I - Zamawiający

  • I.1. Nazwa i adres: Uniwersytet Medyczny w Lublinie
    Al. Racławickie 1 1
    20-059 Lublin, woj. lubelskie
    tel. 81 528 88 88, fax. 81 528 89 18
    REGON: 00028871600000
  • Adres strony internetowej zamawiającego: www.am.lublin.pl
  • I.2. Rodzaj zamawiającego: Uczelnia publiczna

Sekcja II - Przedmiot zamówienia, przetargu

  • II.1. Określenie przedmiotu zamówienia
  • II.1.1. Nazwa nadana zamówieniu przez zamawiającego:
    Dostawa pakietów oprogramowania statystycznego; Nr sprawy UM-ZP-262-57/11
  • II.1.2. Rodzaj zamówienia: dostawy
  • II.1.3. Określenie przedmiotu oraz wielkości lub zakresu zamówienia:
    1. Przedmiotem zamówienia jest dostawa pakietów oprogramowania statystycznego tj. analityczne lub naukowe pakiety oprogramowania; matematyczne lub prognozujące pakiety oprogramowania. W w przedmiot zamówienia będzie realizowany w dwóch następujących zadaniach: Zadanie nr 1 - Specjalistyczne oprogramowanie do analizy mikromacierzy aCGH - 1 szt. Zadanie nr 2 - Specjalistyczne oprogramowanie do analizy mikromacierzy ekspresyjnej miRNA - 1 szt. 2. Zamawiający wymaga zaoferowania przedmiotu zamówienia nowego, kompletnego i gotowego do użycia ( tj. bez żadnych zbędnych i dodatkowych inwestycji). 3. Ilekroć w opisie przedmiotu zamówienia zawartym w SIWZ wskazane zostały normy , znaki towarowe, patenty lub pochodzenie, zamawiający dopuszcza rozwiązania równoważne. 4. Za ofertę równoważną Zamawiający uzna tę która spełnia wszystkie wymagania Zamawiającego określone w opisie przedmiotu zamówienia zawartym w rozdziale. IV SIWZ 5. Ewentualne wskazanie przez zamawiającego nazwy, producenci maja na celu określenie klasy produktu będącego przedmiotem zamówienia i służą ustaleniu standardu nie wskazują natomiast na konkretny wyrób lub konkretnego producenta. 6. Wykonawca który powoła się na rozwiązania równoważne jest zobowiązany wskazać że oferowany przez niego przedmiot zamówienia spełnia wymagania określone przez Zamawiającego. Szczegółowy opis przedmiotu zamówienia: Zadanie nr 1 Kryteria równoważności dla programu Nexus CopyNumber Specjalistyczne oprogramowanie do analizy mikromacierzy aCGH Parametry wymagane 1. Oprogramowanie obsługujące wszystkie obecnie znane typy mikromacierzy aCGH: Affymetrix, Agilent, Roche Nimble Gene, Gene Pix, ImaGene, macierze samodzielnie nadrukowane i inne. 2. Oprogramowanie pozwalające na analizę wyników dla wszystkich organizmów. 3. Oprogramowanie pozwalające na stosowanie techniki dye-swap 4. Możliwość analizy tysięcy macierzy w pojedynczym projekcie. 5. Oprogramowanie obliczające QC próbki. 6. Możliwość integracji z zewnętrznymi, publicznymi bazami danych (NCBI, UCSC, Google, Ensemble, DECIPHER) i z bazami samodzielnie stworzonymi. 7. Oprogramowanie umożliwiające integrację danych fenotypowych z danymi klinicznymi. 8. Automatyczna identyfikacja regionów różniących się znacząco statystycznie pomiędzy populacjami próbek. 9.Analiza przeżywalności z wykreśleniem krzywych Kaplana- Meiera. 10.Grupowanie próbek w oparciu o zmiany w genomie. 11.Możliwość analizy i wizualizacji SNP (single nucleotide polymorphism), CNV (copy number variation), LOH (loss of heterozygosity) uzyskanych z macierzy SNP i aCGH. 12.Integracja wyników uzyskanych z wykorzystaniem technik mikromacierzowych aCGH, ekspresji genów, ekspresji miRNA oraz metylacji genomu. 13.Dostęp do publicznych baz danych udostępnianych przez grupy badawcze z różnych laboratoriów na całym świecie, zajmujących się podobną tematyką. Możliwość porównania własnych wyników z wynikami uzyskanymi przez inne laboratoria. 14.Roczna licencja, w trakcie trwania licencji wsparcie i pomoc merytoryczna producenta programu. 15.Możliwość wysyłania otrzymanych wyników do producenta oprogramowania i analiza wyników online. Pomoc w interpretacji wyników (ocena jakościowa przeprowadzonego eksperymentu, określenie statusu (obecność/brak zmian genomowych) w jednym, wielu genach regionach, miRNA we wszystkich analizowanych próbach, identyfikacja powszechnie występujących aberracji w genomie badanych prób, identyfikacja prób niosących podobne zmiany, identyfikacja genów i dróg przekazywania sygnału podlegających statystycznie częściej zmianom w grupie badanej, identyfikacja jednostek chorobowych, w których dochodzi do identycznych zmian jak w grupie analizowanej, identyfikacja zmian w genomie o cechach predykcyjnych, porównanie prób ze względu na cechy kliniczne, zmiany w obrębie regionów i czynniki wprowadzone bezpośrednio przez użytkownika, identyfikacja aberracji w obrębie regionów korelujących z DFS i czasem przeżycia). 16.Konieczność integracji z utworzonym formatem bazy danych (dane pacjentów, cechy kliniczne choroby) oraz z wynikami uzyskanymi we wcześniejszych badaniach z zastosowaniem macierzy aCGH (np. zidentyfikowane już aberracje o znaczeniu predykcyjnym, zmiany klasyfikujące próby na podgrupy itp). 17. Certyfikat potwierdzający zaawansowaną znajomość oprogramowania. 18.Udzielona będzie licencja na 1 rok użytkowania programu Zadanie nr 2 Kryteria równoważności dla programu ImaGene Nexus Specjalistyczne oprogramowanie do analizy mikromacierzy ekspresyjnych miRNA 1.Oprogramowanie obsługujące miRCURY LNA TM microRNA Array. 2.Możliwość integracji z zewnętrznymi, publicznymi bazami danych dla miRNA w bazie miRBase and TargetScan. 3.Oprogramowanie pozwalające na analizę obrazów tif. pochodzących ze zeskanowanych macierzy miRCURY LNA TM MicroRNA. 4.Oprogramowanie pozwalające na ekstrakcję intensywności sygnału z mikromacierzy i równoczesną ich jakościową analizę statystyczną. 5.Oprogramowanie obliczające QC próbki. 6.Normalizacja i identyfikacja ulegających odmiennej ekspresji miRNA. 7.Oprogramowanie umożliwiające integrację danych fenotypowych z danymi klinicznymi. 8.Automatyczna identyfikacja regionów różniących się znacząco statystycznie pomiędzy populacjami próbek. 9.Analiza przeżywalności z wykreśleniem krzywych Kaplana- Meiera. 10.Analiza skupień - grupowanie próbek w oparciu o zmiany w ekspresji miRNA. 11.Identyfikacja zmian w genomie o cechach predykcyjnych, porównanie prób ze względu na cechy kliniczne analizowanej jednostki chorobowej, zmiany w ekspresji miRNA i czynniki wprowadzone bezpośrednio przez użytkownika, identyfikacja genów miRNA korelujących z DFS i czasem przeżycia. 12.Udzielona będzie licencja na 1 miesiąc użytkowania programu.
  • II.1.4. Wspólny Słownik Zamówień (CPV): 484630001
  • II.1.5. Czy dopuszcza się złożenie oferty częściowej: tak
  • II.1.6. Czy dopuszcza się złożenie oferty wariantowej: nie
  • II.1.7. Czy przewiduje się udzielenie zamówień uzupełniających: nie
  • II.2. Czas trwania zamówienia lub termin wykonania: 7 dni

Sekcja III - Informacje o charakterze prawnym, ekonomicznym, finansowym i technicznym

  • III.1. Warunki dotyczące zamówienia
  • Informacja na temat wadium: Nie dotyczy

Sekcja IV - Procedura przetargowa

  • IV.1. Tryb udzielenia zamówienia
  • IV.1.1. Tryb udzielenia zamówienia: przetarg nieograniczony
  • IV.2. Kryteria oceny ofert
  • IV.2.2. Wykorzystana będzie aukcja elektroniczna: nie
  • IV.3. Informacje administracyjne
  • IV.3.1. Adres strony internetowej, na której dostępna jest specyfikacja istotnych warunków zamówienia: www.umlub.pl
  • IV.3.5. Termin związania ofertą, okres w dniach: 30 (od ostatecznego terminu składania ofert)

Zobacz następny przetargZobacz poprzedni przetargPobierz ofertę w pliku pdfPowrót na stronę główną

Podobne ogłoszenia o przetargach